Основной путь проникновения уропатогенов восходящий — через уретру (уриногенный), редко — нисходящий (гематогенный), другие пути – лимфогенный, контактный, в клинической практике редки. Развитию симптомной ИМП способствуют нарушения уродинамики при органических заболеваниях мочевых путей (мочекаменная болезнь, аномалии, аденома предстательной железы и другие, дисплазии почек) или дисфункциях (дискинезии - рефлюксная, гипотоническая); при снижении иммунитета (иммуносупрессивная терапия, синдром приобретенного иммунодефицита, сахарный диабет и другие причины) или гормонального статуса, а также нарушение микробиома мочевых путей при нерациональной антибактериальной терапии.