Профилактика ОТИН заключается в предупреждении или прекращении воздействия вредных факторов, например, ряда лекарственных препаратов. Эффективное и своевременное лечение инфекции мочевых путей может также явиться фактором снижения риска ОТИН инфекционного генеза. Выявление и устранение токсических производственных и иных факторов риска также снижает риск ОТИН.