2.1. Приоритетные критерии для забора материала для секвенирования:
- от лиц, прибывших из-за рубежа;
- от контактных с прибывшими из-за рубежа;
- от контактных с лицами, у которых выявлен штамм SARS-CoV-2 «вызывающий озабоченность» (VOC);
- от лиц с подозрением на повторное инфицирование SARS-CoV-2;
- от лиц, инфицированных (с признаками и без признаков заболевания), спустя 30 и более суток после вакцинации;
- от больных с устойчивостью к лечению препаратами на основе специфических антител;
- от всех лиц с нетипичным течением заболевания (длительная вирусемия более 21 дня, наличие симптомов со стороны желудочно-кишечного тракта, нервной системы и др.) без сопутствующей патологии;
- от лиц из эпидемических очагов (в т.ч. семейных);
- от детей и подростов до 17 лет с клиническим признаками заболевания.
С учетом складывающейся эпидемиологической ситуации в субъекте Российской Федерации критерии для забора материала для секвенирования могут быть изменены.
2.2. Дополнительно целесообразно обеспечить забор материала с «потока» – от амбулаторных и стационарных пациентов
2.3. Общий объем направленных на секвенирование проб из субъектов Российской Федерации – не менее 10% от всех положительных исследований (ПЦР) в неделю.
2.4. Доставка биоматериала осуществляется не менее двух раз в неделю по согласованию с лабораториями, проводящими секвенирование
2.5. Требования к отбору материала.
2.5.1. В случае положительного результата ПЦР отбирается носоглоточный мазок в транспортной среде, который затем отравляется в соответствующую лабораторию. Допустимые для использования типы транспортных сред определяются строго по согласованию с организацией, осуществляющей секвенирование.
2.5.2. Лаборатории, проводящие секвенирование, самостоятельно определяют пригодность проб для проведения секвенирования.
2.5.3. Образцы необходимо подвергать глубокой заморозке и хранить до передачи в лабораторию в условиях, не допускающих их повторной разморозки, обеспечивая холодовую цепочку при транспортировке материала; при пересылке в течение 24 часов и менее от момента отбора материала образцы допускается перевозить при +4 С, не замораживая.
2.5.4. Для отбора респираторных мазков используются пробирки для взятия респираторных мазков, содержащих транспортную среду. Допускается использование криопробирок объемом 1,5-2 мл с внешней резьбой и завинчивающимися крышками с уплотнительным кольцом, исключающим протекание биологической жидкости, в которые внесена транспортная среда в объёме 0,6 мл. Недопустимо использовать другой тип пробирок. Пробирки с материалом должны иметь четкую несмываемую маркировку.