Физиология микроорганизмов изучает процессы их роста, развития, питания, размножения, сохранения внутренней устойчивости и равновесия с внешней средой, способы получения и накопления энергии для осуществления этих процессов, а также химический состав микробной клетки и субклеточных структур.