Метаболомика (от англ. metabolomics, греч. metabolism + -omics - «полный, целый, весь») - научная область, изучающая совокупность всех исходных, промежуточных и конечных продуктов метаболизма и их количественное содержание в организме.
Из промежуточных и конечных продуктов метаболизма строятся все клеточные субструктуры.
Метаболом - совокупность всех метаболитов (метаболический профиль), являющихся продуктами обмена веществ в клетках, тканях, органах и организме в целом.
Термин введен по аналогии с транскриптомикой и протеомикой. Метаболом меняется постоянно, так же как меняются транскриптом и протеом.
Транскриптомика (данные об экспрессии мРНК генов) и протеомика (данные протеомного анализа) не раскрывают полностью процессы, происходящие в клетке. Метаболические профили метаболомики дают мгновенный снимок составов, лежащих в основе физиологических процессов в организме. Соответственно, метаболомику можно рассматривать как раздел молекулярной физиологии.
В метаболомике для определения концентраций интермедиатов метаболизма применяют различные методы разделения и идентификации химических веществ.
Цель определения концентраций интермедиатов - воссоздание общей картины распределения потоков компонентов исходных субстратов в продукты жизнедеятельности клеток.
Одна из проблем метаболомики обусловлена тем, что с химической точки зрения многие интермедиаты метаболизма сходны по строению, поэтому их сложно отделить друг от друга стандартными физико-химическими методами. В организме в ходе метаболизма эти сходные соединения, как правило, опознаются ферментами и могут иметь различное значение для жизнедеятельности клетки.
Еще одна принципиальная проблема метаболомики связана с тем, что время жизни многих интермедиатов в клетке очень мало (эти вещества химически нестабильны в клеточных экстрактах), а их содержание в клетке очень сильно зависит от условий, в которых протекает жизнедеятельность организма.