Часть I. СИТУАЦИОННЫЕ ЗАДАЧИ ПО БИОЛОГИЧЕСКОЙ ХИМИИ Раздел 1. СТРОЕНИЕ, СВОЙСТВА И ФУНКЦИИ АМИНОКИСЛОТ, ПЕПТИДОВ И БЕЛКОВ

СТРУКТУРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКОВ. ОСНОВЫ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ БЕЛКОВ

1. На рис. 1.1 представлена схема белка, состоящего из одной полипептидной цепи и имеющего активный центр, а также структуры четырех лигандов.

Рис. 1.1. Схема строения белка и лигандов

Выберите из четырех представленных лигандов один, который с наибольшей вероятностью будет взаимодействовать с активным центром белка. Для этого:

а) напишите формулы аминокислот, входящих в состав активного центра;

б) объясните, чем обусловлена специфичность связывания белка с лигандом;

в) укажите, какие связи возникают между выбранным вами лигандом и активным центром;

г) дайте определение активного центра белка и объясните, на каком уровне структурной организации он формируется; укажите, какую роль играет активный центр в функционировании белка;

д) объясните значение первичной структуры белка в формировании активного центра и приведите примеры влияния изменения первичной структуры белков на их активность.

2. На рис 1.2 представлено схематическое изображение белка и структуры различных лигандов.

Рис. 1.2. Схема строения белка и лигандов

Выберите из четырех представленных лигандов один, который с наибольшей вероятностью будет взаимодействовать с активным центром белка. Для этого:

а) напишите формулы аминокислот, входящих в состав активного центра, дайте определение понятия «активный центр белка» и укажите его роль в функционировании белков;

б) объясните, какой принцип лежит в основе специфического взаимодействия белка и лиганда;

в) объясните, какие связи возникают между выбранным вами лигандом и активным центром;

г) объясните, что такое «конформационная лабильность» белков и какую роль она играет в функционировании белков.