Возбудители микозов легких - микроскопические грибы (микромицеты ) - значительно отличаются от других возбудителей инфекций (бактерий, вирусов и простейших). Возбудителей грибковых инфекций подразделяют на оппортунистические и контагиозные (эндемичные), последние вызывают микозы у иммунокомпетентных людей и распространены в определенных регионах. В России эндемические зоны для этих возбудителей
(C. immitis, H. capsulatum, B. dermatitidis, P. brasiliensis) не обнаружены, известны единичные случаи «завоза» эндемичных микозов из-за рубежа. Основными возбудителями микозов легких являются оппортунистические микромицеты Aspergillus spp., реже встречаются Candida spp. и мукормицеты (Rhizopus spp. и др.), очень редко - Cryptococcus neoformans, гиалогифомицеты (Fusarium spp. и др.) и феогифомицеты (Cladosporium spp. и др.).