В настоящее время под учреждением понимают некоммерческую организацию, созданную собственником для осуществления управленческих, социально-культурных или иных функций некоммерческого характера. Учреждения здравоохранения решают социальную функцию оказания медицинской помощи целевой группе в рамках сметного финансирования, а с разрешения органа управления здравоохранения занимаются также медицинским бизнесом (оказанием платных медицинских услуг) в рамках товарообмена медицинских услуг на денежные средства с зачислением их на лицевые счета органов Федерального казначейства.
В Российском здравоохранении в настоящее время введены три вида учреждений:
- бюджетное с расширенным объемом права;
- казенное;
- автономное.
Государственные или муниципальные учреждения функционируют в трех формах - как автономные, казенные и бюджетные. Изменение типа государственного или муниципального учреждения не является его реорганизацией, требуется лишь внесение изменений в уставные документы. Исходя из предлагаемого перечня федеральных учреждений здравоохранения, казенными станут преимущественно специализированные учреждения, финансирование которых в настоящее время осуществляется за счет бюджетов всех уровней, количество которых будет крайне ограничено (психиатрические с интенсивным наблюдением, лепрозории, противочумные). Большинство учреждений здравоохранения планируется реформировать по типу бюджетных или автономных. Несмотря на то что учредителем государственных (муниципальных) учреждений всех типов (бюджетного, казенного, автономного) служит государство или орган местного самоуправления, субсидиарная ответственность
государства в лице учредителей всех уровней за деятельность бюджетных учреждений снимается и сохраняется только за деятельность казенных учреждений.