Микробная контаминация операционной раны является неизбежной, даже при идеальном соблюдении правил асептики и антисептики. К концу операции раны обсеменены различной микрофлорой, чаще всего стафилококками, поэтому процедура ПАП является обязательным элементом системы профилактики ИОХВ при целом ряде оперативных вмешательств. В настоящее время профилактическое назначение антибиотиков является одним из наиболее эффективных мероприятий (но не единственным) по предупреждению ИОХВ.
Использование ПАП в хирургической практике необходимо для снижения частоты ИОХВ, оптимизации использования антибиотиков в хирургии согласно принципам доказательной медицины, сведения к минимуму влияния антибиотиков на нормальную микрофлору пациента и защитные механизмы макроорганизма, сведение к минимуму вероятности развития нежелательных лекарственных реакций.
Разработка стратегии ПАП должна учитывать как пользу, так и возможный риск, связанный с профилактическим применением антибиотиков, который исходит из оценки риска возникновения ИОХВ у пациента, оценки тяжести возможных последствий возникновения ИОХВ, эффективности применения ПАП при данной операции, возможных неблагоприятных последствий применения антибиотиков (увеличение стоимости лечения, формирование резистентных к антибиотикам штаммов микроорганизмов, возникновение неблагоприятных исходов у пациентов (например, ассоциированный с применением антибиотиков колит и т.п.)