Для эпидемиологического анализа и проведения адекватных профилактических и лечебных мероприятий клинические штаммы возбудителя синегнойной инфекции должны быть типированы. Обычно для этого применяют серо-, пиоцинои фаготипирование. Серологическое типирование культур Pseudomonas aeruginosa используют главным образом для следующих целей:
выявление наличия или отсутствия штаммов синегнойной палочки преобладающих серологических типов;
обнаружение идентичности штаммов, вделенных от больных и из окружающей среды;
выявление доминирования штаммов специфических серотипов в определенный период времени.
Серологическое типирование культур синегнойной палочки производят методом агглютинации на стекле с использованием набора, состоящего из поливалентных сывороток к О- антигенам и моновалентных сывороток к факторам О-антигена.
Типирование клинических штаммов Pseudomonas aeruginosa проводят также по способности клеток продуцировать определенные пиоцины. В число нетипируемых входят, как правило, мукоидные штаммы, так как образуемый ими пиоцин оказывается связанным псевдокапсулой и не диффундирует в агар. С помощью пиоцинотипирования обычно выявляются наиболее распространенные типы, что ограничивает их ценность как эпидемиологических маркеров.
Пиоцино - и фаготипирование клинических штаммов синегнойной палочки являются вспомогательными методами, позволяющими более детально дифференцировать эти культуры при проведении эпидемиологического анализа вспышек инфекции и изучения эпидобстановки в стационаре. Однако, эти методы не нашли широкого распространения из-за отсутствия стандартных фагов и пиоцинов.
Из всех перечисленных методов, наиболее воспроизводимые и надежные результаты дают молекулярно-генетические методы, серотипирование, далее следуют пиоцинотипирование, резистенстипирование и наименее эффективным и довольно сложным для постановки является фаготипирование.
К молекулярно-генетическим методам типирования относится амплификация MLVA (анализ множественных тандемных повторов), мультилокусное секвенирование-типирование с последующей оценкой
родственности путем кластеризации или построения дендрограмм.
Широкое применение генодиагностики и генотипирования позволит повысить уровень диагностики инфекции, вызванных Pseudomonas aeruginosa и предоставит возможность более полного эпидемиологического слежения за распространенностью различных вариантов их возбудителей.