Основные диагностически значимые антигены Pseudomonas aeruginosa - соматический О- и жгутиковый Н- антигены. Серологическую идентификацию культур и выявление их принадлежности к определенному серотипу (серовару) проводят по наличию у выделенной культуры сочетания группоспецифичного О- антигена и типоспецифичного Н- антигена.
О-антигенный комплекс сложный макромолекулярный агрегат липополисахарида с белками и липидами клеточной стенки. Липополисахарид эндотоксина образует типоили группоспецифический термостабильный О-- антиген, на основе структуры которого проводят серологическое типирование, т.е он основной структурный компонент О- антигена, обусловливающий его специфичность. Структура липополисахарида Pseudomonas aeruginosa аналогична строению липополисахарида прочих грамотрицательных бактерий и включает липид А (базовая структура) и О-специфические боковые цепи. Белковый компонент эндотоксина представляет антигенный комплекс, общий для псевдомонад, то есть родовой О- антиген. По структуре О- антигена выделяют более 20 серогрупп, но высокая антигенная вариабельность Pseudomonas aeruginosa обусловливает постоянное увеличение их количества.
Н, или жгутиковый антиген представлен термолабильными белками низкой специфичности, обусловленной различиями в строении флагеллинов. Выявлено 15 различных типов Н- антигенов. Н- антиген выявляют лишь у жизнеспособных, подвижных бактерий, не подвергшихся какому-либо химическому воздействию (в частности дезинфектантов) и в культурах, выращенных на жидких средах (особенно дополненных глицерином).
У мукоидных штаммов можно обнаружить капсульный К-антиген. До настоящего времени его диагностическая значимость была невелика, так как подходы к его идентификации по структуре не разработаны. Однако, как более поверхностно расположенный антиген он способен маскировать О-детерминанты, искажая О-агглютинабельность.
В целом, вирулентность Pseudomonas aeruginosa определяется суммой факторов, которые неодинаково активны в разных фазах и при различных формах инфекционного процесса.