Ряд пациентов может подвергаться гормональной терапии или химиотерапии на предоперационном этапе (неоадъювантная терапия). Ответ инвазивного рака на такую терапию является важным прогностическим фактором с точки зрения безрецидивной и общей выживаемости. Для морфологической оценки лечебного патоморфоза было предложено несколько классификаций. С практической точки зрения лечебный патоморфоз в первичной опухоли и в метастазах в лимфатических узлах следует подразделять на полный и неполный либо его отсутствие.
Стадия после неоадъювантной терапии также имеет важное прогностическое значение. Категории T и N в этом случае маркируются добавлением префикса «y» (ypT и ypN).
Инвазивный рак с минимальным ответом на терапию может не измениться в размерах. С увеличением степени ответа на терапию в опухоли снижается количество клеток инвазивного компонента и увеличивается объем фиброзированной стромы. Категория Т оценивается по наибольшему фокусу инвазивного рака. Префикс «m» используется в случае обнаружения множественных фокусов инвазивного рака. При оценке размеров опухоли нельзя учитывать бесклеточные зоны фиброзированного ложа опухоли. Если после проведенного лечения участки инвазивного рака не обнаружены, но остались структуры протокового рака in situ и/или метастазы в регионарных лимфатических узлах, то это отражается в патолого-анатомическом заключении без указания стадии.
После терапии большинство опухолей имеют ту же степень злокачественности по Ноттингемской системе, что и до начала лечения. В некоторых случаях степень злокачественности может быть выше за счет более выраженного ядерного полиморфизма. В редких случаях степень злокачественности может стать ниже из-за снижения митотической активности опухоли.
Если перед началом терапии инвазивный компонент опухоли был негативен по экспрессии рецепторов эстрогенов, прогестерона и/или Her-2, рекомендуется повторить исследование рецепторного статуса опухоли после терапии, так как в ряде случаев может быть обнаружено существенное изменение рецепторного статуса из-за внутриопухолевой гетерогенности и ограниченности материала, получаемого для первичной диагностики.