Этиология большинства первичных системных васкулитов неизвестна. Наиболее доказана взаимосвязь возникновения узелкового полиартериита с инфицированием вирусом гепатита B, а эссенциального криоглобулинемического васкулита - с вирусом гепатита С. Обсуждают участие в развитии пурпуры Шенлейна-Геноха стрептококков, стафилококков, парвовируса В19, вируса Эпштейна-Барр, а в развитии ББ - вируса простого герпеса. Важную роль в обострении гранулематоза Вегенера играют инфекции St. aureus и Pneumocystis jiroveci.