Одной из основных причин отсутствия ощутимых результатов в борьбе с туберкулёзом в России является постоянное увеличение числа больных, у которых выявляют лекарственно-устойчивые штаммы M. tuberculosis, особенно к препаратам первого ряда - рифампицину (Р) и изониазиду (И), что классифицируется как МЛУ.
По данным В.И. Литвинова и соавт. (2005), в Москве среди впервые выявленных больных туберкулёзом лёгких 8-10% составляют лица, заражённые МЛУ M. tuberculosis, и до 25% - пациенты с хроническим течением процесса. В Российской Федерации процент таких больных значительно выше и составляет от 16 до 50% соответственно.
Применяемые микробиологические методы для определения чувствительности к противотуберкулёзным препаратам занимают 1,5-3 мес, что не позволяет своевременно начать проведение индивидуальной специфической терапии, а результаты часто могут быть использованы только для ретроспективного анализа. Более дорогие и менее распространённые альтернативные методы определения чувствительности на жидких средах позволяют сократить сроки определения до 3 нед.
С применением молекулярно-биологических методов определение лекарственной чувствительности M. tuberculosis возможно в короткие сроки (до 2 сут), что, в свою очередь, позволит незамедлительно назначить адекватную антибактериальную терапию. Поскольку молекулярные механизмы резистентности M. tuberculosis, ассоциированные с мутациями в бактериальной ДНК к основным противотуберкулёзным препаратам Р и И, довольно хорошо изучены, решение данной диагностической задачи в первую очередь связано с разработкой быстрого и надёжного метода идентификации мутаций, ответственных за возникновение лекарственной устойчивости.
Среди молекулярно-биологических методов, позволяющих выявить мутации в ДНК M. tuberculosis, наиболее близким к внедрению в лабораторную практику является метод биологических микрочипов, разработанный в Институте молекулярной биологии (ИМБ) им. В.А. Энгельгардта, - "ТБ-БИОЧИП". С его помощью можно определять наличие в образце микобактерий туберкулёзного комплекса и проводить одновременное определение резистентности M. tuberculosis к двум препаратам Р и И. Метод включает двухэтапную мультиплексную ПЦР участков генов (мутации в которых приводят к возникновению устойчивости), гибридизацию и регистрацию продуктов реакции на биочипе. Дискриминирующие олигонуклеотиды, размещённые на биочипе, способны обнаруживать мутации в генах rpoB (для 95% рифампицинрезистентных штаммов) и katG, inhA, ahpС (для 80% изониазидрезистентных штаммов). Результаты гибридизации регистрируются на портативном анализаторе "Чип-детекторе" с соответствующим программным обеспечением ("Биочип-ИМБ", Россия).