Физиотерапия противопоказана при острых воспалительных заболеваниях внутренних органов, доброкачественных новообразованиях в зонах облучения, сахарном диабете, тиреотоксикозе, заболеваниях печени и почек с выраженным нарушением функций.
При применении внутриорганного электрофореза цитостатиков помимо общих противопоказаний для электрофореза учитывают противопоказания для применения вводимого лекарственного препарата.