Возбудители микозов лёгких - микроскопические грибы (микромицеты) значительно отличаются от других возбудителей инфекций (бактерий, вирусов и простейших). Возбудителей грибковых инфекций подразделяют на оппортунистические и контагиозные (эндемичные), вызывающие микозы у иммунокомпетентных людей и распространённые в определённых регионах. В России эндемические зоны для этих возбудителей (Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis) не обнаружены, известны единичные случаи "завоза" эндемичных микозов из-за рубежа. Наиболее распространёнными возбудителями микозов лёгких являются оппортунистические микромицеты Aspergillus spp., реже встречаются Candida spp., Cryptococcus neoformans, зигомицеты (Rhizopus, Absidia, Mucor spp.), гиалогифомицеты (Fusarium, Acremonium, Paecilomyces и Scedosporium spp.) и феогифомицеты (Bipolaris spicifera, Cladophialophora bantiana, Alternaria, Cladosporium, Curvularia spp.). Идентификация возбудителей грибковых пневмоний является важным условием успешного лечения.