В ходе проведения АСИТ в ответ на введение аллергена могут возникнуть нежелательные побочные эффекты в виде местных или системных реакций.
К местным относят реакции, возникающие в месте введения аллергена. Для них характерна местная гиперемия, иногда ощущение зуда в области инъекции, признаки отёка ткани. Эти реакции возникают в пределах первых 30 мин, хотя следует иметь в виду, что они могут возникнуть и в более отдалённые сроки. Возникновение местных реакций - повод для коррекции дозы аллергена (её повторения или уменьшения) в последующее введение.
Системные реакции - реакции, возникающие вне области введения аллергена. Если эти реакции возникают, то они проявляются в пределах нескольких минут после инъекции аллергена и в редких случаях - спустя 30 мин. Обосновано подразделение системных реакций на реакции, не угрожающие жизни пациента, и угрожающие реакции (АШ, отёк жизненно важных органов, например гортани; выраженный бронхоспазм). К системным реакциям могут быть отнесены такие, как головная боль, боли в суставах, ощущение дискомфорта. К умеренным признакам системных реакций относят лёгкие проявления ринита или БА (ПСВ не ниже 60% от должной величины или от показателя пациента в период стойкой ремиссии), хорошо контролируемые соответствующими препаратами (блокаторами
Н1-рецепторов гистамина или ингаляционными агонистами β2-адренорецепторов). Более выраженной степени реакции соответствуют признаки крапивницы, отёки Квинке, нарушение бронхиальной проходимости (показатели ПСВ ниже 60% от должной величины или от показателя пациента в период стойкой ремиссии), контролируемые соответствующим лечением. Угрожающие жизни реакции требуют проведения интенсивной терапии. При возникновении системных реакций пересмотр программы АСИТ для данного пациента обязателен.