Клинические проявления крайне разнообразны, однако специфических симптомов удвоений ЖКТ не существует. Поэтому непостоянство жалоб, стёртость клинической симптоматики и "необычное сочетание обычных симптомов" можно считать характерной триадой дупликаций (Долецкий С.Я., 1979).
Для каждого вида дупликаций существуют характерные сочетания симптомов и патологических состояний. Так, изолированные сферические удвоения, энтерокистомы чаще симулируют опухолевидные образования брюшной полости, могут вызывать сдавление внутренних органов. Воспалительно-деструктивные изменения, характерные для этого вида удвоений, происходят в результате скопления секретируемого эпителием слизистого секрета в просвет замкнутой полости. При сообщающихся тубулярных и дивертикулярных удвоениях более часто встречают эктопию эпителия (желудочного или панкреатического происхождения) и, как следствие, такие осложнения, как изъязвление и кровотечение в просвет желудочно-кишечного тракта. Кишечная непроходимость на фоне удвоений может возникать при инвагинации дупликатуры, её завороте, формировании спаек, связанных с наличием воспалительных изменений при изъязвлении или деструкции в замкнутой полости, о чём было сказано выше. При сообщении удвоения с просветом мочевыделительной системы (так называемые кишечно-мочевые свищи) можно обнаружить выделение каловых масс из мочевых путей.
Необходимо отметить, что для верхних отделов пищеварительного тракта (при удвоениях желудка, двенадцатиперстной кишки, желчевыводящих путей) более характерны изолированные удвоения и эктопия эпителия. Удвоения желудка располагаются, как правило, на задней поверхности большой кривизны. В клинической картине превалируют следующие симптомы. Рвоту встречают наиболее часто, она может быть необильной в начале заболевания, нередко с примесью крови. Кровотечение при желудочных удвоениях может основным симптомом, как осложнение язвенных дефектов, при эктопии чужеродного для желудочной слизистой оболочки эпителия. При неблагоприятном течении возможны также пенетрация и перфорация подобных язв с развитием перфоративного разлитого перитонита. В запущенных стадиях или при локализации удвоения в области пилорического канала возникает рвота "фонтаном", иногда симулирующая клиническую картину пилоростеноза. В верхних отделах живота, главным образом в эпигастральной области, пальпируется опухолевидное образование, как правило, подвижное, безболезненное, не спаянное с окружающими тканями и имеющее гладкую, эластичную поверхность. Таким образом, необходимо проводить дифференциальную диагностику с кистами и опухолями брюшной полости и забрюшинного пространства, пилоростенозом.