Наибольшую сложность представляет дифференциальная диагностика отёка и ишемии мозга, часто эти процессы сочетаются. При необходимости дифференцировки применяют специальные методики (магнитно-резонансную спектроскопию с изучением метаболитов, магнитно-резонансные или компьютерно-томографические перфузионные и диффузионные исследования).