Острые инфекции верхних дыхательных путей
Возбудители респираторных инфекций ВДП обычно попадают в дыхательные пути через нос и носоглотку, где впервые сталкиваются с резидентной микробиотой и начинают конкурировать за ресурсы, необходимые для успешной колонизации слизистых оболочек. Поскольку носоглотка и ротоглотка связаны анатомически, то и колонизирующие носоглотку микроорганизмы могут также стать участниками микробиома ротоглотки [1]. Носоглотка считается первичной экологической нишей, из которой потенциальные бактериальные и вирусные патогены мигрируют в носовые пазухи и среднее ухо, а также в мозговые оболочки. Напротив, считается, что диссеминация в легкие происходит в первую очередь путем аспирации из ротоглотки, хотя у детей младшего возраста и носоглотка может быть альтернативным источником инфекции из-за анатомических различий, а именно из-за преимущественно носового дыхания и большого объема назальных выделений [1]. Инфекции НДП распространены гораздо реже, чем инфекции ВДП, что говорит о том, что сдерживание патогенов на уровне ротоглотки может быть высокоэффективным, что, возможно, является результатом формирования крайне разнообразной комбинации респираторных, желудочно-кишечных и кожных микроорганизмов в полости рта.
Изменения респираторного микробиома, связанные с инфекционными заболеваниями, включают следующие: повышенное содержание респираторных патогенов, таких как Haemophilus influenza типа b и Streptococcus spp., а также снижение содержания «защитников»-комменсалов, таких как Corynebacterium, Dolosigranulum и Moraxella spp. [2, 3].
Интересно, что, по опубликованным данным, изменения в микробиоме ВДП предшествуют клиническим признакам инфекций, что позволяет предположить причинно-следственную связь. Наблюдение когорты детей раннего возраста показало, что у детей с нарушенной траекторией формирования микробиома ВДП, а именно с повышенной плотностью оральных бактерий в составе микробиома носоглотки, впоследствии регистрировалось больше эпизодов острых инфекций ВДП [4]. Однако просто наличия воспалительного сдвига в профиле бактериального сообщества носоглотки недостаточно, чтобы вызвать клинически манифестное заболевание, поэтому внешними триггерами процесса будут аллергены или вирусы. Например, инфицирование вирусом способно усилить уровень колонизации слизистых оболочек бактериальными патогенами в результате повреждения эпителиального барьера, влияя на врожденное звено иммунного ответа и способствуя пролиферации бактериальных клеток [5].
Микробиом ВДП не только влияет на восприимчивость к острым респираторным инфекциям, но также причастен и к модуляции степени тяжести инфекций НДП. Было установлено, что риск госпитализации по поводу тяжелой РС-вирусной инфекции ассоциирован с обогащением микробного профиля носоглотки S. pneumoniae и H. influenzae, тогда как высокое содержание S. aureus связано с легким течением этой инфекции [6].
На мышах были получены и другие экспериментальные доказательства. Было показано, что респираторный микробиом снижает риск смерти при инфицировании вирусом гриппа. Происходит это в связи с подавлением чрезмерного противовирусного иммунного ответа и ограничения площади повреждения легочной ткани [7]. Другие доказательства были получены при исследовании метаболома у младенцев с вирусными инфекциями НДП, когда повышенное содержание Streptococcus spp. в микробиоме носоглотки было связано с повышенным уровнем воспалительных сфинголипидов и повышением тяжести инфекции [8]. Вместе обозначенные выше научные данные еще раз свидетельствуют о том, что респираторный микробиом играет важную роль в патогенезе острых инфекций дыхательной системы, в том числе и вирусной этиологии.