Клиническая микробиология исследует микробиологические аспекты патогенеза, лабораторной диагностики, специфической профилактики и химиотерапии инфекционных болезней в неинфекционной клинике.
К задачам клинической микробиологии относятся:
• изучение роли условно-патогенных микроорганизмов в патогенезе инфекционных заболеваний;
• разработка методов лабораторной диагностики, специфической профилактики и этиотропной терапии инфекционных заболеваний в неинфекционном стационаре;
• исследование эпидемиологических аспектов внутрибольничных инфекций;
• мониторинг лекарственной устойчивости возбудителя в лечебно-профилактических учреждениях.
Для решения данных задач специалист по клинической лабораторной диагностике должен располагать необходимой информацией о составе и свойствах представителей нормальной микрофлоры, характерной для различных биотопов тела человека, и возбудителях инфекций различных систем организма. Одно из обязательных условий - правильный забор материала, поскольку это обеспечивает достоверность получаемых результатов.
В рамках клинической микробиологии наряду с условно-патогенными микроорганизмами, вызывающими оппортунистические инфекции, рассматривают патогенные микроорганизмы и вызываемые ими инфекции.
Под оппортунистической инфекцией понимают инфекционный процесс, развивающийся, как правило, на фоне иммунодефицитного состояния макроорганизма (иммунокомпрометированные хозяева), вызываемый условнопатогенными микроорганизмами.
Заболевания, связанные с оказанием медицинской помощи, обозначают термином ятрогенная, или нозокомиальная, инфекция.
К микроорганизмам, вызывающим оппортунистические инфекции, относится большое количество возбудителей, среди которых представители родов Staphylococcus, Streptococcus, Escherichia, Klebsiella, Serratia, Proteus, Bacillus, Mycoplasma, Pneumocystis, Acinetobacter, Bacteroides, Mycobacterium, Candida, Cryptococcus, Pseudomonas, Haemophilus, Enterobacter, Peptostreptococcus, Providencia, Branhamella, Moraxella, Flavobacterium, Fusobacterium и др.