Прогноз заболевания при отсутствии сопутствующих заболеваний, как правило, благоприятный. При некротической и флегмонозной форме омфалита возможно поражение внутренних органов, генерализация инфекционного процесса, сепсис.
Дифференциальную диагностику следует проводить со следующими заболеваниями и состояниями:
- пупочная гранулема (видимая гранулема на основание пупка)
- остатки желточно-кишечного протока (кистозные опухоль или свищевое отверстие)
- открытый урахус (свищевое отверстие или киста)