Прогноз при остром вирусном гепатите C существенно улучшился с внедрением противовирусной терапии, своевременное назначение которой позволяет добиться выздоровления более чем у 90% больных. Если пациенты не получают противовирусную терапию, прогноз хуже: у 15-20% больных с прогрессирующим течением заболевания возможно формирование цирроза печени в течение 20-30 лет после инфицирования. На фоне цирроза печени с частотой 1-4% в год возникает первичная гепатоцеллюлярная карцинома.