| Клиническая группа | Заболевание | Возбудители |
| Поверхностные микозы | Отрубевидный лишай | Malassezia spp. |
| Перхоть |
| Себорейный дерматит |
| Белая пьедра | Trichosporon spp. |
| Черная пьедра | Piedraia hortae |
| Кожные микозы | Дерматофитии волосистой части головы, гладкой кожи, ногтей | Microsporum spp. |
| Trichophyton spp. |
| Epidermophyton spp. |
| Nannizzia spp. |
| Кандидозы кожи, слизистых оболочек, ногтей | Candida spp. |
| Pichia kudriavzevii |
| Nakaseomyces glabratus |
| Другие дерматомикозы кожи, ногтей | Onychocola canadensis |
| Microascus brevicaulis |
| Подкожные микозы | Споротрихоз | Sporothrix schenckii |
| Хромобластомикоз | Fonsecaea spp. |
| Phialophora spp. |
| Cladophialophora |
| Феогифомикоз | Alternaria alternata |
| Cladophialophora bantiana |
| Curvularia spp. |
| Exophiala dermatitidis |
| Грибковая мицетома | Exophiala jeanselmei |
| Trematosphaera grisea |
| Madurella mycetomatis |
| Scedosporium boydii |
| Лобомикоз | Lacazia loboi |
| Диморфные системные микозы (эндемичные микозы) | Гистоплазмоз | Histoplasma capsulatum |
| Кокцидиоидоз | Coccidioides immitis/posadasii |
| Бластомикоз | Blastomyces dermatitidis |
| Паракокцидиоидоз | Paracoccidioides spp. |
| Оппортунистические микозы | Кандидоз | Candida spp. |
| Pichia kudriavzevii |
| Nakaseomyces glabratus |
| Криптококкоз | Cryptococcus neoformans |
| Пневмоцистоз | Pneumocystis jirovecii |
| Аспергиллез | Aspergillus spp. |
| Трихоспороноидоз | Trichosporon spp. |
| Мукормикозы | Rhizopus spp. |
| Mucor spp. |
| Rhizomucor pusillus |
| Lichtheimia corymbifera |
| Гиалогифомикоз | Acremonium spp. |
| Paecilomyces spp. |
| Fusarium spp. |
| Scopulariopsis spp. |
| Феогифомикоз | Exophiala spp. |
| Cladophialophora spp. |
| Exserohilum spp. |
| Curvularia spp. |
| Кератиты, эндофтальмиты, ретиниты | Fusarium spp. |
| Aspergillus spp. |
| Candida spp. |
| Acremonium spp. |
| Scedosporium spp. |
| Paecilomyces spp. |
| Curvularia spp. |
| Bipolaris spp. |
| Exserohilum spp. |
| Отомикоз | Aspergillus niger |
| Candida spp. |
| Fusarium spp. |