Диагноз предракового поражения (или заболевания) выставляется на основании прижизненного патологоанатомического исследования биопсийного или операционного материала — патогистологического выявления дисплазии эпителия (слабой, умеренной или тяжелой, или по-другому: I, II, III степени) в биопсийном материале. В настоящее время вместо понятия «дисплазия» чаще применяются термины плоскоклеточная интраэпителиальная неоплазия (от англ. squamous intraepithelial neoplasia) и плоскоклеточные интраэпителиальные поражения (от англ. squamous intraepithelial lesions), также обычно трех степеней. При этом следует помнить, что плоскоклеточная интраэпителиальная неоплазия (или плоскоклеточные интраэпителиальные поражения) III степени включает не только тяжелую дисплазию, но и рак in situ.
В случае патологоанатомического диагноза доброкачественного или злокачественного новообразования его кодируют по периодически обновляемой Международной гистологической классификации опухолей — Международной классификации болезней в онкологии и по Международной статистической классификации болезней и проблем, связанных со здоровьем, 10-го пересмотра (в ближайшие годы планируется внедрить ее 11-й пересмотр). Большинство злокачественных опухолей требуется также кодировать по последней действующей версии международной классификации стадий их прогрессии — системе TNM.