Микрофлора человека является неотъемлемой частью его организма и имеет огромное значение для поддержания и регулирования оптимального уровня метаболических процессов.
С целью детального изучения микробиоты человека и ее влияния на функционирование органов и систем был создан проект «Микробиом человека». Сам термин «микробиом» был предложен в 2001 г. американским генетиком и биохимиком Джошуа Ледербергом. Под микробиомом понимают совокупность генов всех симбиотических микроорганизмов, населяющих определенную среду. Применительно к человеку различают микробиомы частей тела, обильно населенных различными видами микробов, — кишечника, полости рта, дыхательных путей, кожного покрова и урогенитального тракта, а также совокупный геном микроорганизмов, колонизирующих все части тела (микробиом человека). Микробиом человека активно участвует в осуществлении его жизнедеятельности (Костин И.Н. и др., 2013; Savage D.C., 1977). Взаимодействие микробиома желудочно-кишечного тракта и человека представляет собой мутуалистический симбиоз: организм человека обеспечивает питание и адекватную физическую среду для микробных популяций, которые, в свою очередь, осуществляют важные функции, такие как содействие развитию иммунной системы и защиту от кишечных инфекций (Chow J. et. al., 2010).
Исследования по оценке микробиома эндометрия и его роли в репродукции ограниченны, поскольку длительный период времени считалось, что верхний отдел полового тракта является стерильным (Tissier H., 1900), а эпителиальные клетки слизистой оболочки шейки матки представляют собой непроницаемый барьер для проникновения условно-патогенных микроорганизмов. В 2007 г. I. Zervomanolakis и соавт. была продемонстрирована возможность проникновения мелких меченых частиц из заднего отдела влагалища через шейку матки в матку до фаллопиевых труб во время фолликулярной и лютеиновой фаз МЦ. L.K. Hansen и соавт. (2014) доказали, что бактерии способны проникать через слизистую пробку шейки матки. В большинстве этих работ использовались традиционные культуральные методы исследования и микроскопия, которые, несмотря на их ограничения, до сих пор считаются актуальными.
Благодаря развитию более точных микробиологических методов исследования произошло изменение парадигмы (рис. 11.1), постулатом которой являлась идея о том, что полость матки — стерильный компартмент верхних отделов генитального тракта (Тапильская Н.И. и др., 2014). В последнее десятилетие активно исследуется видовой состав микроорганизмов, колонизирующих полость матки (Khan K.N. et al., 2016; Moreno I. et al., 2016; Verstraelen H. et al., 2016; Chen C. et al., 2017; Tao X. et al., 2017), а также комменсальная колонизация плаценты (Aagaard K. et al., 2014; Prince A.L. et al., 2016). Для оценки микробиоты человека стали применять молекулярно-биологические подходы, основанные на анализе генов и геномов микроорганизмов. В частности, для анализа совокупных геномов микробных популяций, или микробиомов, различных органов и частей тела человека широко применяется метод секвенирования гена 16S рРНК (его видоспецифичных областей). Метагеномный анализ продвинул вперед исследования естественной колонизации человеческого тела, выявив микробиоту на участках тела, которые ранее считались стерильными. Данные методы позволяют не только детально описать видовой состав микробиоценоза, но и определить долю каждого вида в микробиоценозе, что позволило существенно расширить представления о физиологической и патологической микрофлоре различных органов человека, в том числе влагалища и полости матки (Цыпурдеева Н.Д. и др., 2018; Baker J.M. et al., 2018).
Появляется все больше свидетельств того, что микробиота эндометрия обладает большим видовым разнообразием и может изменяться при возникновении различных патологических состояний, влияющих на репродуктивный потенциал. В табл. 11.1 обобщены все данные о микробном составе эндометрия, полученные при применении различных методов диагностики и забора материала.
Авторы | Кол-во, абс. | Клиническая группа | Метод получения материала | Методика микробиологического анализа | Выделенные (преобладающие) микроорганизмы |
M.T. Pezzlo и соавт. (1979) | 46 | Эндометрит; без эндометрита | Трансцервикально; мазок из полости матки | Культуральный | 76% положительных проб: Bacteroides spp. (45%), анаэробные грамположительные кокки (23%), Clostridia (9%), анаэробные грамположительные палочки (9%), Veillonella (9%), Escherichia coli (9%), стрептококки группы D (41%), стрептококки группы B (36%), Staphylococcus aureus (9%), Staphylococcus epidermidis (18%), Diphtheroids spp. (23%), Lactobacillus spp. (36%), Candida spp. (5%) |
J. Paavonen и соавт. (1985) | 32 | ВЗОМТ | Трансцервикально; аспират эндометрия (пайпель) | ИФА; культуральный | 100% положительных проб: C. trachomatis (39%), Аnaerobic bacteria (Peptostreptococcus spp., Bacteroides bivius, B. melaninogenicus) (30%), альфа-гемолитический стрептококк (26%), стрептококк группы В (26%), Staphylococcus aureus (26%), Haemophilus influenzae (26%), M. hominis (17%), U. urealyticum (13%), N. gonorrhoeae (13%), Herpes simplex virus (4,3%) |
N.B. Kiviat и соавт. (1990) | 69 | ВЗОМТ | Трансцервикально; соскоб эндометрия | ИФА; культуральный | 55% положительных проб: C. trachomatis/N. gonorrhoeae (49%), E. coli (2,9%), Peptostreptococcus spp. (1,4%), Streptococcus agalactiae (1,4%) |
B.R. Møller и соавт. (1995) | 99 | Ациклические кровотечения; миома матки | Гистерэктомия | Культуральный; ПЦР | 25% положительных проб: G. vaginalis, Enterobacter, Streptococcus agalactiae |
C.R. Cohen (2002) | 115 | Эндометрит; без эндометрита | Трансцервикально; соскоб эндометрия | ПЦР | 17% положительных проб: M. genitalium |
В.И. Краснопольский и соавт. (2004) | 100 | Неразвивающаяся беременность; искусственный аборт | Трансцервикально; соскоб эндометрия | Культуральный; ПЦР | 100% положительных проб: U. urealyticum, вирус простого герпеса, M. hominis, C. trachomatis, цитомегаловирус, стрептококки групп B и D, Staphylococcus epidermidis, Peptostreptococcus spp. |
F. Polisseni и соавт. (2003) | 50 | Бесплодие | Трансцервикально; соскоб эндометрия | ПЦР | C. trachomatis не выявлены |
W.W. Andrews и соавт. (2005) | 820 | Преждевременные роды; индуцированные преждевременные роды; роды в анамнезе | Трансцервикально; аспират эндометрия (пайпель) | Культуральный; ПЦР | 82% положительных проб: Gardnerella vaginalis, Lactobacillus spp., S. viridans, Peptostreptococcus spp., M. hominis, U. urealyticum, S. agalactiae, Staphylococcus spp., Diphtheroid spp., Gemella morbillorum, Enterococcus faecalis, Propionibacterium acnes, Prevotella bivius, Mobiluncus spp., C. trachomatis, S. aureus |
E. Cicinelli и соавт. (2008) | 2190 | ДМК; бесплодие; полип эндометрия; субмукозная миома матки; аномалии мочеполовой системы | Трансцервикально; кюретка 3 мм, соединенная со шприцем 20 мл | Культуральный; ИФА | 73,1% положительных проб: Streptococcus spp. (38%), Enterococcus faecalis (19,4%), Escherichia coli (15,6%), U. urealyticum (13,7%), Candida spp. (8,1%), Staphylococcus spp. (6,2%), C. trachomatis (3,7%) |
Е. Cicinelli и соавт. (2009) | 181 | ХЭ | Трансцервикально; кюретка 3 мм, соединенная со шприцем 20 мл | Культуральный; ПЦР | 74,6% положительных проб: Escherichia coli (11%), Streptococcus spp. (11%), Enterococcus faecalis (11%), Staphylococcus spp. (11%), U. urealyticum (11%), C. trachomatis (2,8%) |
Е. Cicinelli и соавт. (2012) | 404 | ХЭ | Трансцервикально; кюретка 3 мм, соединенная со шприцем 20 мл | Культуральный; ПЦР | 69% положительных проб: стрептококки группы В (27%), E. faecalis и E. coli (31%), U. urealyticum (10%), M. hominis (0,2%) |
A. Swidsinski и соавт. (2013) | 46 | Искусственный аборт; ДМК; полип эндометрия | – | Флюоресцентная гибридизация in situ | 50% положительных проб: биопленки, формируемые G. vaginalis (62%) |
S.L. Hillier и соавт. (2013) | 136 | ВЗОМТ | Трансцервикально; аспират эндометрия (пайпель) | Культуральный; ПЦР | 50% положительных проб: G. vaginalis (35%), A. vaginae (22%), Prevotella timonensis, P. amnii, Peptoniphilus harei (11%) |
М.Н. Чертовских, С.И. Кулинич (2013) | 287 | Бесплодие; неудачи ЭКО | Трансцервикально; аспират эндометрия (папель) | Культуральный | 87,8% положительных проб: Candida spp. (17,4%), Peptostreptococcus spp. (9,5%), Enterococcus spp., Propionibacterium spp. (14%), Prevotella spp. (8,3%), M. hominis (6,7%), Morganella (7,1%), Staphylococcus spp. (6,7%), U. urealyticum (6,7%), Fusobacterium spp. (6,3%), Propionibacterium spp. (8,3%), Klebsiella spp. (5,1%), Mobiluncus spp. (4,7%), Enterobacter (3,5%), Bacteroides spp. (1,9%), трихомонады (1,9%) |
Е. Cicinelli и соавт. (2014) | 360 | ХЭ | Трансцервикально; кюретка 3 мм, соединенная со шприцем 20 мл | Культуральный; ПЦР; ИФА | 68,3% положительных проб: M. hominis/U. urealyticum (25,3%), Enterococcus faecalis (22,9%), Escherichia coli (16,9%), C. trachomatis (12,7%), Streptococcus agalactiae (11,9%), Streptococcus bovis (4,9%), Streptococcus mitis (4,9%), Streptococcus milleri (4,2%), Klebsiella pneumoniae (2,8%), Streptococcus viridans (2,8%), Staphylococcus hemolyticum (2,8%), Staphylococcus aureus (2,1%), Staphylococcus epidermidis (0,7%), Candida spp. (0,7%) |
C.M. Mitchell и соавт. (2015) | 58 | ДМК; миома матки; болевой синдром | Гистерэктомия | ПЦР; секвенирование участков гена 16S рибосомальной РНК | 95% положительных проб: L. iners (45%), Prevotella spp. (33%), L. crispatus (33%) |
C.L. Haggerty и соавт. (2016) | 545 | ВЗОМТ | Трансцервикально; аспират эндометрия | ПЦР | 85% положительных проб: Sneathia sanguinegens, Sneathia amnionii, Atopobium vaginae и BVAB1, U. parvum, U. urealyticum |
Н.А. Гомболевская (2016) | 241 | ХЭ; без ХЭ | Трансцервикально; аспират эндометрия | Культуральный; ПЦР | Культуральный (без ХЭ): Streptococcus spp. и Staphylococcus spp. (8%), Lactobacillus spp. и Bifidobacterium spp. (48%). Культуральный (ХЭ): Streptococcus spp. (20,2%), бактерии семейства Enterobacteriaceae (13,1%), Gardnerella vaginalis (13,1%), Staphylococcus spp. (10,7%), Enterococcus faecalis (10,7%), Lactobacillus spp. и Bifidobacterium spp. (38%). ПЦР (ХЭ): бактерии семейства Enterobacteriaceae (30,7%), Lactobacillus spp. (30%), G. vaginalis, P. bivia, Porphyromonas spp. (21,8%), Ureaplasma spp. (15,8%), Eubacterium spp. (10,9%), Streptococcus spp. (8,9%), C. trachomatis (1%), цитомегаловирус (3%) |
Н. Verstraelen и соавт. (2016) | 19 | Привычное невынашивание беременности; неудачи ЭКО | Трансцервикально; соскоб эндометрия (цитощетка Tao Brush) | Секвенирование участков гена 16S рибосомальной РНК | B. xylanisolvens, B. thetaiotaomicron, B. fragilis, L. crispatus или L. iners |
С. Chen и соавт. (2017) | 110 | НГЭ; миома матки; аденомиоз | Во время лапароскопии/лапаротомии | Секвенирование участков гена 16S рибосомальной РНК; ПЦР: культуральный | Lactobacillus spp. (30,6%), Pseudomonas spp. (9,09%), Acinetobacter spp. (9,07%), Vagococcus spp. (7,29%), Sphingobium spp. (5%) |
К. Kyono и соавт. (2018) | 102 | Бесплодие | Трансцервикально; аспират эндометрия | Секвенирование участков гена 16S рибосомальной РНК | Lactobacillus spp., Gardnerella spp., Streptococcus spp., Atopobium spp., Bifidobacterium spp., Sneathia spp., Prevotella spp., Staphylococcus spp. |
К. Kyono и соавт. (2019) | 92 | Бесплодие; неудачи ЭКО | Трансцервикально; аспират эндометрия | Секвенирование участков гена 16S рибосомальной РНК | 47 случаев (51,1%) с преобладанием Lactobacillus spp. (>90%), 45 (48,9%) случаев со снижением количества Lactobacillus spp. (<90%) и преобладанием Atopobium spp. Bifidobacterium spp. + Gardnerella spp., Megasphaera spp. Sneathia spp., Prevotella spp. (>10%) |