Микрофлора человека является неотъемлемой частью его организма и имеет огромное значение для поддержания и регулирования оптимального уровня метаболических процессов.
С целью детального изучения микробиоты человека и ее влияния на функционирование органов и систем был создан проект «Микробиом человека». Сам термин «микробиом» был предложен в 2001 г. американским генетиком и биохимиком Джошуа Ледербергом. Под микробиомом понимают совокупность генов всех симбиотических микроорганизмов, населяющих определенную среду. Применительно к человеку различают микробиомы частей тела, обильно населенных различными видами микробов, - кишечника, полости рта, дыхательных путей, кожного покрова и урогенитального тракта, а также совокупный геном микроорганизмов, колонизирующих все части тела (микро-биом человека). Микробиом человека активно участвует в осуществлении его жизнедеятельности (Костин И.Н. и др., 2013; Savage D.C., 1977). Взаимодействие микробиома желудочно-кишечного тракта и человека представляет собой мутуалистический симбиоз: организм человека обеспечивает питание и адекватную физическую среду для микробных популяций, которые, в свою очередь, осуществляют важные функции, такие как содействие развитию иммунной системы и защиту от кишечных инфекций (Chow J. et. al., 2010).
Исследования по оценке микробиома эндометрия и его роли в репродукции ограниченны, поскольку длительный период времени считалось, что верхний отдел полового тракта является стерильным (Tissier H., 1900), а эпителиальные клетки слизистой оболочки шейки матки представляют собой непроницаемый барьер для проникновения условно-патогенных микроорганизмов. В 2007 г. I. Zervomanolakis и соавт. была продемонстрирована возможность проникновения мелких меченых частиц из заднего отдела влагалища через шейку матки в матку до фаллопиевых труб во время фолликулярной и лютеиновой фаз МЦ. L.K. Hansen и соавт. (2014) доказали, что бактерии способны проникать через слизистую пробку шейки матки. В большинстве этих работ использовались традиционные культуральные методы исследования и микроскопия, которые, несмотря на их ограничения, до сих пор считаются актуальными.