На сегодняшний день бактериальный микробиом изучен достаточно глубоко, однако гораздо меньше нам известно о микобиоме и вироме. Как и бактерии, грибы и вирусы, очевидно, весьма разнообразны в кишечнике, и уже есть данные о том, что они также вступают во взаимодействие с иммунитетом хозяина [965-969]. При этом все еще не ясно, какие функции грибы и вирусы выполняют в поддержании гомеостаза хозяина и насколько они важны для здоровья человека. В некоторых ранних исследованиях уже были изучены микобиомы и виромы у пациентов с иммуносупрессией и обсуждалась их роль в ассоциации с противовирусной терапией и глубиной нарушений иммунитета [965, 970, 971]. Вероятно, на данном этапе уже стоит активизировать исследование сообществ вирусов и грибов, проживающих в организме человека, в особенности у пациентов со сниженным иммунитетом. Изучение этих групп может быть особенно эффективно для понимания роли микобиома и вирома, а также ассоциированных с ними рисков.
МИКОБИОМ В МЕДИЦИНЕ
Заболевания, вызываемые представителями царства грибов, поражают более 300 млн человек во всем мире ежегодно, при этом погибает более 1,6 млн человек [972]. Все больше пациентов подвержено рискам инвазивных грибковых инфекций, в том числе пациенты со злокачественными новообразованиями и после пересадки органов и тканей, получающие иммуносупрессивную или иммуномодулирующую терапию, люди, живущие с ВИЧ, и многие другие восприимчивые группы населения.
Известно, что культуральные методы недостаточно чувствительны и слишком задерживают время для диагностики грибковых инфекций [973, 974]. Их точность зависит от выбора биообразца, типа гриба, а также особенностей заболевания и иммунного статуса пациента. Например, пневмоцисты не способны вырасти на питательных средах [18], а выделение Aspergillus spp. в крови, как правило, малоэффективно и редко встречается в диагностике инвазивного аспергиллеза [974, 975]. Отметим, что в сравнении со спектром доступных антибактериальных средств всего четыре класса противогрибковых препаратов активно