Со времени 1-го издания национального руководства по инфекционным болезням в 2009 г. в структуре заболеваемости инфекционными болезнями произошли существенные изменения. Так, увеличилась заболеваемость вирусными диареями, геморрагическими лихорадками, произошла крупнейшая эпидемия лихорадки Эбола, распространилась на новые регионы РФ лихорадка Западного Нила (ЛЗН), продолжается пандемия ВИЧ-инфекции, в то же время благодаря улучшению санитарно-бытовых условий, проведению вакцинации снизилась заболеваемость вирусным гепатитом В (ВГB), брюшным тифом. Не регистрируются на территории РФ случаи сыпного тифа, снижается заболеваемость пневмококковой, гемофильной и менинго-кокковой инфекциями.
Значительно усовершенствовались методы специфической диагностики, в частности ПЦР-диагностики, используются автоматические диагностические системы [полимеразная цепная реакция (ПЦР) + масс-спектрография + газожидкостная хроматография]. Значительное развитие получили биохимические методы диагностики и прогнозирования исхода болезни. Шире применяются инструментальные методы диагностики [магнитно-резонансная томография (МРТ), ультразвуковое исследование (УЗИ) и другие]. Произошли существенные сдвиги в чувствительности возбудителей инфекционных болезней (бактерий, простейших, вирусов) к этиотропным препаратам, все более реальной становится проблема широкого распространения полирезистентных штаммов возбудителей, что требует более рационального подхода к назначению антимикробных препаратов, более широкого применения бактериофагов. Дальнейшее распространение и совершенствование получили методы интенсивной терапии и реанимации. Разрабатываются и внедряются в практику стандарты диагностики и лечения ряда инфекционных болезней, в частности вирусного гепатита (ВГ).