В настоящее время финансирование традиционных КДЛ проводится, как правило, по остаточному принципу. Лабораториям неизвестен бюджет, на который она может рассчитывать в течение определенного срока. Не проводится анализ финансовых затрат при внедрении новых технологий, не функционирует механизм устойчивого поступления необходимых финансовых средств для обеспечения бесперебойного выполнения лабораторных исследований.
Централизация лабораторных исследований предполагает коренное изменение экономических условий деятельности централизованной КДЛ. Эти изменения затрагивают на первоначальном этапе централизации источники и механизмы финансирования деятельности лаборатории. Обеспечение гарантированного финансирования лабораторных затрат из бюджетных источников и создание условий для их рационального использования - важнейшая задача руководителей региональных органов управления здравоохранением и ФОМС.
Централизованная КДЛ имеет все предпосылки для обеспечения самофинансирования и саморазвития. Материальные затраты и стоимость лабораторных услуг легко просчитать, так как хорошо известны стоимость оборудования и его амортизации, лабораторных реагентов, трудовых затрат, объем исследований и другие факторы. Достаточно точно можно рассчитать бюджет клинико-диагностических лабораторий.
Основными источниками поступлений финансовых средств в централизованную КДЛ могут служить оплата лабораторных услуг из систем ФОМС и ДМС, оказание лабораторных услуг коммерческим медицинским учреждениям, а также выполнение платных лабораторных услуг населению. На первоначальном этапе при создании централизованных КДЛ важно запустить и отладить эти механизмы финансирования лабораторий.
В дальнейшем по мере развития централизованных КДЛ перед руководителями региональных органов управления здравоохранением, ФОМС и КДЛ встанет задача практического использования современных подходов к оценке экономической эффективности деятельности лабораторий с целью их выживания в рыночных условиях, успешной конкуренции на рынке лабораторных услуг с другими централизованными и коммерческими КДЛ и достижения коммерческого успеха.