Многочисленные ассоциации микробов, населяющих кишечник человека, в значительной мере определяют его духовное и физическое здоровье.
И.И. Мечников
Взаимоотношения между человеком (макроорганизмом) и окружающим его микромиром формировались на протяжении многих тысячелетий, а возможно, и миллионов лет. В своей эволюции они прошли несколько исторических этапов. На первом этапе это были отношения взаимного противостояния, противоборства: организм человека упорно сопротивлялся вторжению чужеродных ему микроорганизмов. В этом противостоянии, как полагают, погибла не одна человеческая линия. На втором этапе взаимодействия макроорганизм и проникшая в него микрофлора вступили в компромиссные взаимоотношения путем сглаживания взаимного антагонизма и сосуществования на принципах комменсализма (commensal - сотрапезник). На третьем этапе путем преодоления комменсализма сформировался гармоничный симбиоз на принципах мутуализма, когда и макроорганизм, и эндосимбионтные бактерии извлекают определенные преимущества от их сожительства, обеспечивающего благоприятные условия для сохранения популяции симбионтных бактерий и их деятельное участие в обмене веществ, иммунной защите организма человека и т.п. [1].
Таким образом, корни взаимной адаптации и истоки возникновения сбалансированной микроэкологической системы «макроорганизм - эндосимбионтные бактерии» уходят в далекое прошлое [2, 3].
Мутуализм как высшая форма симбиоза - это устойчивая форма сосуществования человека и эндосимбионтных бактерий, но она сохраняется лишь до тех пор, пока не нарушен взаимовыгодный баланс интересов. В случае подавления жизнедеятельности эндосимбионтных бактерий их место занимают условно-патогенные и патогенные микроорганизмы и возникают сначала обратимые, а затем и необратимые изменения в организме человека, которые способствуют развитию болезней и угрожают самой его жизни [1, 3-6]. А с гибелью хозяина (человека) окончательно исчезает и вся популяция эндосимбионтных бактерий. Ввиду этого одной из важнейших функций эндосимбионтной микрофлоры, колонизирующей толстую кишку человека, является сохранение и стабилизация среды своего обитания, защита ее от проникновения чужеродных бактерий и вирусов [4-8].