Клиническое проявление аномалии Эбштейна зависит от степени деформации створок трикуспидального клапана, размеров правых отделов сердца, наличия и степени стеноза клапана ЛА, давления в правом предсердии, степени трикуспидальной недостаточности и наличия или отсутствия веноартериальных шунтов. Возраст, в котором появляется клиническая картина, зависит от степени анатомических и гемодинамических нарушений. Взрослые с аномалией Эбштейна должны наблюдаться в специализированных центрах, имеющих опыт лечения ВПС у взрослых, в частности аномалии Эбштейна.