Этиология фибромиалгии не ясна. Сообщения о семейной агрегации свидетельствуют в пользу наследственного фактора в развитии фибромиалгии.
Есть сообщения о развития фибромиалгии после инфицирования вирусом гепатита C. Внимание уделяется изучению связи фибромиалгии и болезни Лайма.
Предшествуют развитию фибромиалгии травмы, особенно сопровождающиеся неврологическими повреждениями, оперативные вмешательства. Так, у 21,6% женщин с травмой шеи в анамнезе в дальнейшем сформировался синдром фибромиалгии.
Различные структурные или функциональные дефекты позвоночного столба наблюдают у 80% больных с фибромиалгией: так, у 25% женщин с синдромом хронической боли в области спины развился синдром фибромиалгии.
Как показали исследования, в 80-87% случаев развитию фибромиалгии предшествовал анамнез локальной боли. Триггерные факторы - психологический стресс, резкая смена климата. Часто фибромиалгия развивается у больных с ревматическими заболеваниями.