Прогноз УП всегда серьёзен, при отсутствии лечения 5-летняя выживаемость составляет 10%. При лечении ГК и цитостатиками 5-летняя выживаемость значительно возрастает и достигает 80%. Средняя продолжительность жизни больных УП в настоящее время превышает 12 лет.
К факторам неблагоприятного прогноза УП относят: протеинурию более 1 г/сут, наличие HBV-инфекции, развитие почечной недостаточности, поражение сердца, кишечника, ЦНС, начало заболевания в возрасте старше 50 лет. Значительно ухудшает прогноз необходимость хирургического вмешательства, поскольку множественные перфорации внутренних органов часто рецидивируют, а в послеоперационном периоде у больных УП отмечают медленное заживление и инфекционные осложнения.
Более половины летальных исходов УП приходится на первый год заболевания, причина смерти в этот период - неконтролируемое прогрессирование васкулита или осложнения иммуносупрессивной терапии. На более позднем этапе смертность связана с прогрессирующей ХПН или развитием острых сосудистых катастроф у больных со злокачественной гипертонией (острый инфаркт миокарда, инсульт).