Тромб, находящийся в сосудистом русле лёгких, подвергается лизису за счёт системы естественных антикоагулянтов. Даже при отсутствии антикоагулянтной терапии у большинства выживших больных с ТЭЛА наблюдают частичный или полный лизис тромба и восстановление кровотока. Поэтому основные задачи терапии при остром эпизоде ТЭЛА - устранение угрожающих жизни нарушений гемодинамики и предотвращение возможных рецидивов ТЭЛА.