Прежде всего абсцесс лёгкого приходится дифференцировать от полостной формы рака лёгкого и абсцедирования в ателектазе при центральном раке лёгкого. При полостной форме рака лёгкого толщина стенок полости неравномерна: наиболее толстая стенка медиальная, в полости содержится незначительное количество жидкости. Перифокальная реакция больше всего выражена по направлению к корню лёгкого. Форма полости не изменяется при дыхании. Абсцесс лёгкого в ателектазе при центральном раке лёгкого отличается тем, что он проявляется на фоне гиповентиляции соответствующего отдела лёгкого, уплотнения лёгочной ткани. Окончательный диагноз ставят на основании бронхоскопии и биопсии опухоли, а при полостной форме рака - на основании трансторакальной пункции с цитологическим исследованием.
Туберкулёзная каверна отличается от острого абсцесса лёгкого отсутствием содержимого в полости, наличием очагов в лёгких и петрификатов во внутригрудных лимфатических узлах. Окончательный диагноз ставится на основании бактериологического исследования мокроты, смывов из бронхов на туберкулёзную палочку. Гангрену лёгкого иногда приходится дифференцировать от казеозной пневмонии. Для гангрены, в отличие от туберкулёза, характерна гнилостная мокрота с труднопереносимым запахом. Важнейшая роль отводится бактериологическому исследованию.
Эхинококковую кисту редко приходится дифференцировать от абсцесса лёгкого, так как клиническая картина при эхинококкозе очень скудная, а гомогенное затемнение при эхинококке может быть сопоставимым лишь с "блокированным" абсцессом. Однако при последнем резко выражен интоксикационный синдром.