Лечение удвоений желудочно-кишечного тракта - хирургическое, показания к операции устанавливают по мере диагностики. Даже в случаях бессимптомного течения удвоений рекомендуют оперативное лечение, так как описаны случаи малигнизации.
В зависимости от вида удвоения операции могут быть паллиативными и ра-ди-кальными. Паллиативные операции выполняют в случаях протяжённых изолированных удвоений тонкой кишки, расположенных по брыжеечному краю. Радикальные вмешательства при таких формах могут привести к нарушению кровоснабжения и иннервации несущей кишечной трубки или требуют резекции большей части кишечника, что несовместимо с жизнью. Паллиативные вмешательства могут включать кюретаж, марсупиализацию, частичную резекцию и анастомозирование с приводящей кишечной петлёй путём рассечения общей стенки и создания анастомотического "окна" между удвоенным участком и несущим его отделом (желудком, кишкой). Рекомендуют обязательную экспресс-биопсию слизистой оболочки удвоенного отдела для исключения гетеротопии. При её обнаружении выполняют марсупиализацию или демукозацию слизистой оболочки удвоенного отдела из нескольких серозно-мышечных разрезов.
Во всех остальных случаях показаны радикальное удаление удвоенного участка или резекция несущей кишки с удвоением единым блоком. При низких удвоениях и наличии мочевого свища последний обязательно иссекают вместе с дупликатурой или перевязывают. Завершают операцию наложением анатомически выгодного межкишечного анастомоза. Как правило, операцию выполняют в один этап, однако при наличии торако-абдоминальных удвоений у новорождённых и грудных детей, сопутствующих пороках может потребоваться этапное оперативное лечение с раздельным вмешательством на грудной и брюшной полостях. В случае развития разлитого перитонита целесообразнее завершить оперативное вмешательство выведением кишечного свища.