Одной из сложных задач генетики психических заболеваний считают поиск молекулярно-генетических маркёров, позволяющих прогнозировать и/или верифицировать тот или иной фенотип при психической патологии. Молекулярно-диагностическая тест-система должна отвечать следующим требованиям:
+ высокая специфичность в отношении молекулы-мишени;
+ чувствительность для обнаружения небольших количеств мишени;
+ простота, позволяющая получать воспроизводимые и однозначные результаты в условиях клинической лаборатории.
Данным требованиям отвечают два вида методов.
• I. Методы, основанные на сродстве белковых молекул: антиген-антитело, авидин-биотин и др., а также детекция продуктов экспрессии методом иммуноферментного анализа и олигонуклеотидными зондами, конъюгированными с пептидными маркёрами и т.д.
• II. Все методы, основанные на гибридизации нуклеиновых кислот.
К низкой воспроизводимости результатов приводят две группы факторов.
• Высокая генетическая гетерогенность психических нарушений, вследствие которой аналогичные фенотипические проявления характеризуются нарушениями в разных локусах.
• Неизвестные эпигенетические факторы, опосредующие патогенетические механизмы на уровне: транскриптома (различные варианты постранскрипционного процессинга и альтернативного сплайсинга матричной РНК) или протеома (посттрансляционный протеолиз и другие модификации).
Концепция эндофенотипов может в значительной степени упростить поиск генетического сцепления с психическими нарушениями - путём анализа отдельного эндофенотипа и соответствующих ему генетических маркёров.
Эпигенетические факторы могут объяснить неэффективность молекулярно-генетического картирования и идентификации генов, широко применяемых при исследовании моногенных заболеваний. В этой связи одним из перспективных направлений в генетике психических патологий считают изучение генома и хромосомного набора нервных клеток (молекулярная цитогенетика мозга). Не исключено, что этот подход позволит обнаружить мозаичные типы различных хромосомных аномалий и изучить эпигенетические факторы, которые могут иметь решающее значение в этиопатогенезе психопатологии.